自然杂志:如何开发快速可靠的新冠状病毒诊断方法？

本篇文章2116字，读完约5分钟

医学界正在共同努力，为新型冠状病毒开发快速可靠的诊断方法。最近，学术期刊《自然》发表了一篇文章。《生物技术》的新闻稿详细介绍了国际医学界在开发新型冠状病毒诊断方法方面的努力。根据这篇文章，国际研究小组在创纪录的时间内迅速发现了这种病毒。

文章指出，在疫情爆发之初，三个研究小组鉴定并分享了新冠状病毒的基因序列信息，并为鉴定该病毒做出了惊人的努力。

来自上海、武汉、北京和悉尼的一组研究人员利用宏基因组测序从武汉华南海产品市场的一名患者身上提取样本，并鉴定出一种未知的冠状病毒。1月10日，研究小组首次将其初步基因组序列存储在基因银行的公共数据库中。

同时，中国疾病预防控制中心派出的一个小组从3例患者的支气管肺泡灌洗液中分离培养出一种新型冠状病毒。电镜图像显示该病毒具有典型的冠状病毒形态。基因组测序表显示，它与蝙蝠中的非典样冠状病毒有85%的相似性。1月12日，研究小组将三个基因组序列存储在地理信息系统数据库中，可以公开查阅。

来自武汉和北京的第三个研究小组，从另外5名重症肺炎患者身上发现了相同的病毒，并将这5个基因组序列存储在GISAID数据库中。研究小组还发现，病毒通过乙酰乙酸受体进入宿主细胞。

新型冠状病毒的首次诊断试验方法

以上三个团队的公开数据为病毒诊断提供了依据。自然与中等；生物技术公司表示，许多国际组织利用这些序列数据来设计用于聚合酶链式反应检测的引物，从而支持全球公共卫生实验室在没有商业检测方法的情况下进行病毒检测。

1月23日，德国柏林的查里特&埃卡特；医院病毒学研究所克里斯蒂安-米德多特；Drosten教授和其他几个欧洲和香港的合作伙伴发布了新型冠状病毒的实时聚合酶链反应(RT-PCR)诊断测试方法和程序。这项工作被认为是新冠状病毒的第一种诊断测试方法，也成为世界卫生组织(世卫组织)使用的非典-CoV-2分子检测试剂盒的基础。它可以区分传染性非典型肺炎冠状病毒2型和传染性非典型肺炎冠状病毒。自然与中等；生物技术表示，最近几周，世卫组织已向全球159个检测实验室提供了25万套分子检测试剂盒。

Drosten团队在没有SARS-CoV-2分离株或患者样本的情况下验证了该试验，并且在其他呼吸道感染患者的297个临床样本中证实了该试验方法的特异性。

在接受《科技日报》采访时，Drosten表示，他们已经与伦敦、香港、鹿特丹和其他地方的实验室联合进行了大量测试，证明他们的测试仅针对新型冠状病毒，不会对其他病毒产生阳性反应。他还表示，中国于1月10日宣布了新型冠状病毒的完整基因序列，这对于中国开发有针对性的诊断试剂盒非常重要。在此之前，我们进行了一次原则性的测试，但是直到基因序列被公布，我们才能看到我们的方法是正确的，并且新病毒能够被准确地检测到。

1月31日，香港大学公共卫生学院的潘立雄教授的团队基于基因银行上的第一个新冠状病毒基因组序列开发了两种逆转录聚合酶链反应方法。这两种检测方法在从传染性非典型肺炎-CoV-2感染者获得的两个临床样本中得到验证。根据“自然和中等；生物技术报道说，李奥·潘的团队已经与世界卫生组织以及亚洲、非洲、中东和南美洲的30多个实验室分享了测试细节和试剂。

在美国，在2月4日获得美国食品和药物管理局(FDA)的紧急使用授权后，美国疾病控制和预防中心(CDC)也在美国50个州和世界30个地区引入了自己的PCR检测方法。

商用试剂盒和宏基因组检测的添加

这些早期的实验室测试为预防和控制这一流行病赢得了宝贵的时间。在商业试剂盒广泛使用之前，他们为公共卫生部门提供了诊断工具。随后，商业公司开始参与。2020年1月底，BGI在中国各地分发了超过50，000个工具包。2月5日，该公司在武汉开设了火眼应急检测实验室，每天可处理1万个样本。自然与中等；生物技术公司表示，除了BGI，其他公司在开发测试方法方面要慢得多。

在德国汉堡，一家名为Altona Diagnostics的诊断公司正在为β开发新产品。冠状病毒E基因和传染性非典型肺炎冠状病毒-2型病毒S基因的两部分检测方法。

美国公司IDbyDNA使用宏基因组核酸分析作为常规诊断和监测工具。该公司现有的检测方法可以从患者样本的宏基因组数据中识别900多种呼吸道病原体，包括病毒、细菌、真菌和寄生虫。该公司的联合创始人兼首席医疗官表示，他们已经用新型冠状病毒更新了数据，并正在重新验证测试方法。目前，该公司正在向外界出售这项技术和测试服务。

英国爱丁堡大学进化生物学研究所的分子进化教授Andrew Rambaut正在通过分析不同的SARS-CoV-2基因组之间的系谱关系来追踪疫情。根据90个已发表的基因组进行的初步分析表明，在武汉第一例新的冠状病毒出现之前不久，就出现了SARS-CoV-2病毒。

其他流行病学家设计了数字监控工具，通过自动监控官方和非官方的电子信息来跟踪疫情。例如，美国约翰·霍普金斯大学的研究人员已经汇编了关于该流行病发展的官方和媒体报告，以实现对非典-CoV-2病例的实时可视化和跟踪。截至2月19日，该系统拥有超过7800例病例的人口、地理和临床数据，可供研究人员分析和理解。

来源：环球邮报中文网